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勞務(wù)派遣屬于人力資源服務(wù)，適用稅率是6%，按照財稅〔2016〕47號，可以選擇差額納稅，以取得的全部價款和價外費(fèi)用，扣除代用工單位支付給勞務(wù)派遣員工的工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金后的余額為銷售額，按照簡易計稅方法依5%的征收率計算繳納增值稅。
勞務(wù)外包，則應(yīng)按照其業(yè)務(wù)實質(zhì)，全額計算繳納增值稅。比如，外包的是加工、修理修配勞務(wù)，則承包單位應(yīng)按提供加工、修理修配勞務(wù)的計稅規(guī)則全額計算繳納增值稅；外包的如果是建筑服務(wù)，則承包單位應(yīng)按提供建筑服務(wù)的規(guī)定計算繳納增值稅（一般納稅人9%或小規(guī)模納稅人3%）。
主要區(qū)別有以下幾點：
（一）資質(zhì)要求
勞務(wù)派遣公司必須取得人力資源部門核發(fā)的勞務(wù)派遣資質(zhì)證書。
（二）簽訂的合同不同
一是勞務(wù)派遣公司應(yīng)依法與被派遣的勞動者簽訂規(guī)范的勞動合同，并按照人力資源部門的要求實行網(wǎng)上備案。勞動合同中應(yīng)載明被派遣的勞動者的用工單位、派遣期限、崗位等情況；
二是勞務(wù)派遣公司應(yīng)與用工單位簽訂勞務(wù)派遣合同，載明被派遣人員的工資、保險、公積金等數(shù)額。
（三）是否通過金融機(jī)構(gòu)支付工資
勞務(wù)派遣公司支付給被派遣勞動者的工資必須通過銀行轉(zhuǎn)賬方式，要有明細(xì)的銀行流水單據(jù)。
（四）扣除憑證不同
扣除憑證除了第二項中的兩個合同和第三項中的銀行單據(jù)之外，還需要勞務(wù)派遣公司的花名冊、用工單位的花名冊、勞務(wù)派遣公司和用工單位的工資核算明細(xì)賬，以及勞務(wù)派遣公司為勞動者繳納社會保險的繳費(fèi)憑證。
（五）發(fā)票開具不同
選擇差額征稅的，扣除的差額部分不得開具專用發(fā)票，可以通過防偽稅控系統(tǒng)的差額開票功能，差額開具發(fā)票。同時，需要在備注欄中備注上支付給勞動者的工資和五險一金的數(shù)額。
（六）加強(qiáng)對勞務(wù)派遣公司和用工單位的企業(yè)所得稅年度審核鑒證
嚴(yán)格執(zhí)行國稅函（2009）3號和2015年34號公告，不符合規(guī)定的工資和福利費(fèi)，不允許稅前扣除，更防止一筆工資兩頭扣除。
（七）加強(qiáng)部門協(xié)作
營改增前成立的勞務(wù)派遣公司，企業(yè)所得稅一般都在稅務(wù)部門可信息共享，協(xié)調(diào)辦案。同時，稅務(wù)、工商、人力資源、銀行等部門，可聯(lián)合加強(qiáng)對勞務(wù)派遣的監(jiān)督管理，實現(xiàn)信息共享，業(yè)務(wù)互通。
